| 2019년도 | 서울시 | 제68회 서울시 문화상 학술부문상 수상 | 오 유 경 교수 | 물리약학 전공 |
| 2019년도 | PSE-YSM Meeting 2019 in Budapest | The Pierre Favre Award (Phytochemical Society of Europe Pierre Fabre Prize | Marc Diederich 교수 | 생물화학 전공 |
| 2019년도 | 한국펩타이드단백질학회 | 애니젠 학술상 | 이 봉 진 교수 | 물리약학 전공 |
| 2019년도 | 여성생명과학기술포럼 | 제18회 한국로레알-유네스코 여성과학자상(학술진흥상) | 이 미 옥 교수 | 병태생리학 전공 |
| 2019년도 | 과학기술정보통신부 | 국가연구개발 우수성과 100선 선정 | 정 연 석 교수 | 미생물화학 전공 |
| 2019년도 | 한국분자세포생물학회, KSMCB | 여성생명과학자상 | 이 미 옥 교수 | 병태생리학 전공 |
| 2019년도 | 보건복지부 | 보건의료기술진흥 유공자 정부포상, 보건복지부장관 표창(우수연구부문) | 이 정 원 교수 | 생물화학 전공 |
| 2018년도 | 한국의약평론가회 | 약사평론가 선정 | 이 미 옥 교수 | 병태생리학 전공 |
| 2018년도 | 대한면역학회 | 제1회 KAI-Genexine 학술상 우수상 | 정 연 석 교수 | 미생물화학 전공 |
| 2018년도 | 식품의약품안전처 | 약의 날, 식품의약품안전처장 표창 | 이 정 원 교수 | 생물화학 전공 |
| 2018년도 | 3⋅1 문화재단 | 3⋅1문화상 | 이 호 영 교수 | 병태생리학 전공 |
| 2018년도 | 한국과학기술한림원 | 한국과학기술한림원 정회원 선출 | 정 낙 신 교수 | 약화학 전공 |
| 2017년도 | 대한민국학술원 | 제 62회 대한민국학술원상(자연과학응용 부문) | 강 창 율 교수 | 미생물화학 전공 |
| 2017년도 | 한국바이오칩학회 | Biochip Journal 학술상 | 송 준 명 교수 | 약품분석학 전공 |
| 2017년도 | 생화학분자생물학회 | 제 13회 마크로젠 여성과학자상 | 이 호 영 교수 | 병태생리학 전공 |
| 2017년도 | 한국생약학회 | 환당천연약물학술상 | 오 원 근 교수 | 생약학 전공 |
| 2017년도 | 한국분석과학회 | 영인분석과학자상 | 송 준 명 교수 | 약품분석학 전공 |
| 2017년도 | 대한약학회 | 젊은 약학자상 | 정 연 석 교수 | 면역학 전공 |
| 2017년도 | 가송재단-대한약학회 | 운광열 약학상 | 오 유 경 교수 | 물리약학 전공 |
| 2017년도 | 여성생명과학기술포럼 | 로레알-유네스코 여성과학자상 학술진흥상 | 이 호 영 교수 | 병태생리학 전공 |
| 2017년도 | 한림원 | 한국차세대과학기술한림원(Y-KAST) | 이 승 희 교수 | 약물학 전공 |
| 2017년도 | 대한약학회 | 젊은약학자상 | 이 승 희 교수 | 약물학 전공 |
| 2017년도 | 동성제약 | 송암의약학상 | 김 대 덕 교수 | 약재학 전공 |
| 2017년도 | 한독 | 한독학술대상 | 이 봉 진 교수 | 물리약학 전공 |
| 2017년도 | 한국유기합성학회 | 학술상 | 정 낙 신 교수 | 약화학 정공 |
| 2016년도 | 보건복지부 | 제30회 약의 날 대통령 포창 | 정 낙 신 교수 | 약화학 전공 |
| 2016년도 | 교육부 | 대한민국 스승상 | 김 영 철 교수 | 예방약학 전공 |
| 2016년도 | 의약신문사 | 의, 약학평론가상 | 이 봉 진 교수 | 물리약학 전공 |
| 2015년도 | 고려제강 | 석천학술상 | 김 대 덕 교수 | 약제학 전공 |
| 2015년도 | 고려제강 | 석천학술상 | 정 낙 신 교수 | 약화학 전공 |
| 2015년도 | 생화학분자생물학회 | 제 11회 마크로젠 여성과학자상 | 이 미 옥 교수 | 병태생리학 전공 |
| 2015년도 | 인촌기념회 | 인촌상 | 서 영 준 교수 | 생물화학 전공 |
| 2015년도 | 대한약학회 | 대한약학회 학술대상 | 서 영 거 교수 | 약품제조화학 전공 |
| 2015년도 | 호암재단 | 호암상 의학상 | 김 성 훈 교수 | 미생물학 전공 |
| 2015년도 | 한국과학기술한림원 | 환당한림 의약학상 | 김 상 건 교수 | 약물학 전공 |
| 2015년도 | 한국약제학회 | 국제학술대회 학술대상 | 김 대 덕 교수 | 약제학 전공 |
| 2015년도 | 대웅제약 | 제1회 대웅학술상 | 정 낙 신 교수 | 약화학 전공 |
| 2014년도 | 동화약품 | 활명수 약학상 | 정 낙 신 교수 | 약화학 전공 |
| 2014년도 | International Cytokine and Interferon Society | Herbert Tabor Young Investigator Award | 정 연 석 교수 | 미생물화학 전공 |
| 2014년도 | The JBC/Herbert Tabor Foundation | The JBC/Herbert Tabor Young Investigator Award | 정 연 석 교수 | 면역학 전공 |
| 2014년도 | 아시아약학연맹 | 이시다떼상 | 신 완 균 교수 | 임상약학 전공 |
| 2014년도 | 한국유기합성학회 | 한국유기합성학회 대상 | 서 영 거 교수 | 약품제조화학 전공 |
| 2014년도 | GA학회 | GA학회 최고논문상 | 김 영 철 교수 | 예방약학 전공 |
| 2013년도 | 한림원 | 차세대 선도과학자 | 이 승 희 교수 | 약물학 전공 |
| 2013년도 | 여성생명과학기술포럼 | 제12회 한국 로레알-유네스코 여성생명과학상(펠로십) | 이 승 희 교수 | 약물학 전공 |
| 2013년도 | 대한약학회 | 제 44회 한독학술대상 수상 | 강 창 율 교수 | 미생물화학 전공 |
| 2012년도 | 한풍제약 | 한풍상암 생약대상 | 김 진 웅 교수 | 생약학 전공 |
| 2012년도 | 보건복지부 | 보건복지부장관 표창 | 이 봉 진 교수 | 물리약학 전공 |
| 2012년도 | 한국자기공명학회 | 이조웅 학술상 | 이 봉 진 교수 | 물리약학 전공 |
| 2012년도 | 대한민국 | 국무총리표창 | 오 유 경 교수 | 물리약학 전공 |
| 2012년도 | 한국암연구재단 | 보령암학술상 | 서 영 준 교수 | 생물화학 전공 |
| 2012년도 | 대한약학회 | 대한약학회 녹암학술상 | 박 형 근 교수 | 약품제조화학 전공 |
| 2012년도 | 대한민국 학술원상 | 대한민국 학술원상 | 김 성 훈 교수 | 미생물학 전공 |
| 2012년도 | 수생화학분자생물학회 | 청산상 | 김 규 원 교수 | 생물화학 전공 |
| 2012년도 | 동성제약 | 송음 이선규 의,약학상 | 강 삼 식 교수 | 천연물과학 전공 |
| 2011년도 | 가톨릭 서울교구 생명위원회 | 제 5회 생명의 신비상 학술본상 수상 | 강 창 율 교수 | 미생물화학 전공 |
| 2011년도 | 포스코청암재단 | 제3기 청암과학펠로 | 이 승 희 교수 | 약물학 전공 |
| 2011년도 | 대한약학회 | 학술대상 | 서 영 거 교수 | 약품제조화학 전공 |
| 2011년도 | 한국과학기술정보연구원 | 지식창조대상 | 서 영 준 교수 | 생물화학 전공 |
| 2011년도 | 한풍제약 | 한풍상암생약대상 | 김 진 웅 교수 | 생약학 전공 |
| 2009년도 | 한국연구재단 | 한국연구재단 대표우수성과 선정 | 강 창 율 교수 | 미생물화학 전공 |
| 2009년도 | 과학기술정보통신부 | 국가연구개발 우수성과 100선 선정 | 강 창 율 교수 | 미생물화학 전공 |
| 2008년도 | 대한약학회 | 녹암학술상 | 정 낙 신 교수 | 약화학 전공 |
| 2007년도 | 산학협동재단 | 제29회 산학협동상 대상 | 박 정 일 교수 | 분석약학 전공 |
| 2007년도 | 동성제약 | 송음 학술상 | 정 낙 신 교수 | 약화학 전공 |
| 2005년도 | 호암재단 | 호암삼 의학상 | 김 규 원 교수 | 생물화학 전공 |
| 2003년도 | 동성제약 | 이선규 약학상 | 이 봉 진 교수 | 물리약학 전공 |
| 2000년도 | 한국과학기술단체총연합회 | 제 10회 과학기술 우수논문상 | 강 창 율 교수 | 미생물화학 전공 |
